Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zbed3Q9D0L1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
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Zbed3Q9D0L1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zbed3Q9D0L1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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