Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc47Q9D024 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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