Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rab3bQ9CZT8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms