Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssbp2Q9CYZ8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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