Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prelid3bQ9CYY7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms