Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Mis12Q9CY25 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Mis12Q9CY25 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Mis12Q9CY25 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Mis12Q9CY25 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mis12Q9CY25 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mis12Q9CY25 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mis12Q9CY25 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mis12Q9CY25 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mis12Q9CY25 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mis12Q9CY25 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mis12Q9CY25 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mis12Q9CY25 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mis12Q9CY25 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mis12Q9CY25 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mis12Q9CY25 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mis12Q9CY25 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mis12Q9CY25 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Mis12Q9CY25 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mis12Q9CY25 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mis12Q9CY25 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mis12Q9CY25 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mis12Q9CY25 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mis12Q9CY25 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mis12Q9CY25 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mis12Q9CY25 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mis12Q9CY25 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mis12Q9CY25 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mis12Q9CY25 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Mis12Q9CY25 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mis12Q9CY25 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mis12Q9CY25 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mis12Q9CY25 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mis12Q9CY25 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Mis12Q9CY25 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Mis12Q9CY25 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mis12Q9CY25 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mis12Q9CY25 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mis12Q9CY25 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mis12Q9CY25 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mis12Q9CY25 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mis12Q9CY25 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mis12Q9CY25 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mis12Q9CY25 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms