Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx7Q9CY18 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms