Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL3

Uncharacterized protein C7orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CXL3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CXL3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CXL3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CXL3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CXL3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CXL3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CXL3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CXL3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CXL3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CXL3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CXL3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms