Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Sgo1Q9CXH7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Sgo1Q9CXH7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Sgo1Q9CXH7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Sgo1Q9CXH7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Sgo1Q9CXH7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Sgo1Q9CXH7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Sgo1Q9CXH7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Sgo1Q9CXH7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Sgo1Q9CXH7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Sgo1Q9CXH7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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