Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed5Q9CXE7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms