Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnih4Q9CX13 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnih4Q9CX13 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnih4Q9CX13 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnih4Q9CX13 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnih4Q9CX13 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnih4Q9CX13 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnih4Q9CX13 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnih4Q9CX13 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnih4Q9CX13 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnih4Q9CX13 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnih4Q9CX13 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnih4Q9CX13 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnih4Q9CX13 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih4Q9CX13 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih4Q9CX13 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih4Q9CX13 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih4Q9CX13 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih4Q9CX13 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih4Q9CX13 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih4Q9CX13 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih4Q9CX13 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih4Q9CX13 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih4Q9CX13 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih4Q9CX13 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih4Q9CX13 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih4Q9CX13 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih4Q9CX13 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih4Q9CX13 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih4Q9CX13 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih4Q9CX13 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih4Q9CX13 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih4Q9CX13 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih4Q9CX13 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih4Q9CX13 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih4Q9CX13 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih4Q9CX13 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih4Q9CX13 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnih4Q9CX13 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cnih4Q9CX13 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cnih4Q9CX13 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnih4Q9CX13 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms