Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms