Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Sycp2Q9CUU3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Sycp2Q9CUU3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Sycp2Q9CUU3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Sycp2Q9CUU3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Sycp2Q9CUU3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Sycp2Q9CUU3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Sycp2Q9CUU3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Sycp2Q9CUU3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Sycp2Q9CUU3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Sycp2Q9CUU3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Sycp2Q9CUU3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Sycp2Q9CUU3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Sycp2Q9CUU3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Sycp2Q9CUU3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Sycp2Q9CUU3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Sycp2Q9CUU3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Sycp2Q9CUU3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Sycp2Q9CUU3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Sycp2Q9CUU3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Sycp2Q9CUU3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Sycp2Q9CUU3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Sycp2Q9CUU3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Sycp2Q9CUU3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Sycp2Q9CUU3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Sycp2Q9CUU3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Sycp2Q9CUU3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Sycp2Q9CUU3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Sycp2Q9CUU3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Sycp2Q9CUU3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Sycp2Q9CUU3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Sycp2Q9CUU3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Sycp2Q9CUU3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Sycp2Q9CUU3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Sycp2Q9CUU3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Sycp2Q9CUU3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Sycp2Q9CUU3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Sycp2Q9CUU3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Sycp2Q9CUU3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Sycp2Q9CUU3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Sycp2Q9CUU3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Sycp2Q9CUU3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Sycp2Q9CUU3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Sycp2Q9CUU3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
Sycp2Q9CUU3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Sycp2Q9CUU3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Sycp2Q9CUU3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Sycp2Q9CUU3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Sycp2Q9CUU3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Sycp2Q9CUU3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
Sycp2Q9CUU3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Sycp2Q9CUU3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Sycp2Q9CUU3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Sycp2Q9CUU3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Sycp2Q9CUU3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Sycp2Q9CUU3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Sycp2Q9CUU3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Sycp2Q9CUU3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
Sycp2Q9CUU3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Sycp2Q9CUU3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Sycp2Q9CUU3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Sycp2Q9CUU3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
Sycp2Q9CUU3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Sycp2Q9CUU3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
Sycp2Q9CUU3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.78■■■■□ 3
Sycp2Q9CUU3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Sycp2Q9CUU3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Sycp2Q9CUU3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Sycp2Q9CUU3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Sycp2Q9CUU3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Sycp2Q9CUU3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Sycp2Q9CUU3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Sycp2Q9CUU3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■■□ 3
Sycp2Q9CUU3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
Sycp2Q9CUU3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Sycp2Q9CUU3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Sycp2Q9CUU3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Sycp2Q9CUU3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Sycp2Q9CUU3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Sycp2Q9CUU3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Sycp2Q9CUU3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Sycp2Q9CUU3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Sycp2Q9CUU3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Sycp2Q9CUU3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Sycp2Q9CUU3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Sycp2Q9CUU3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Sycp2Q9CUU3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Sycp2Q9CUU3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Sycp2Q9CUU3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Sycp2Q9CUU3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Sycp2Q9CUU3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Sycp2Q9CUU3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Sycp2Q9CUU3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Sycp2Q9CUU3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Sycp2Q9CUU3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Sycp2Q9CUU3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Sycp2Q9CUU3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Sycp2Q9CUU3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Sycp2Q9CUU3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Sycp2Q9CUU3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms