Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930553M12RikQ9CUH1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930553M12RikQ9CUH1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms