Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms