Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.9 ms