Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ndufb9Q9CQJ8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ndufb9Q9CQJ8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ndufb9Q9CQJ8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ndufb9Q9CQJ8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ndufb9Q9CQJ8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ndufb9Q9CQJ8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ndufb9Q9CQJ8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ndufb9Q9CQJ8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ndufb9Q9CQJ8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ndufb9Q9CQJ8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ndufb9Q9CQJ8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ndufb9Q9CQJ8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ndufb9Q9CQJ8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ndufb9Q9CQJ8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ndufb9Q9CQJ8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ndufb9Q9CQJ8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ndufb9Q9CQJ8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ndufb9Q9CQJ8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ndufb9Q9CQJ8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ndufb9Q9CQJ8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ndufb9Q9CQJ8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ndufb9Q9CQJ8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ndufb9Q9CQJ8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ndufb9Q9CQJ8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ndufb9Q9CQJ8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ndufb9Q9CQJ8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ndufb9Q9CQJ8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms