Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzk1ip1Q9CQH0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms