Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CQF4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CQF4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CQF4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CQF4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CQF4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CQF4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CQF4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CQF4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CQF4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms