Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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Atp6v0e1Q9CQD8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Atp6v0e1Q9CQD8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Atp6v0e1Q9CQD8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Atp6v0e1Q9CQD8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atp6v0e1Q9CQD8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atp6v0e1Q9CQD8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Atp6v0e1Q9CQD8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Atp6v0e1Q9CQD8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atp6v0e1Q9CQD8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atp6v0e1Q9CQD8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atp6v0e1Q9CQD8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Atp6v0e1Q9CQD8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Atp6v0e1Q9CQD8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Atp6v0e1Q9CQD8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Atp6v0e1Q9CQD8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Atp6v0e1Q9CQD8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Atp6v0e1Q9CQD8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Atp6v0e1Q9CQD8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Atp6v0e1Q9CQD8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Atp6v0e1Q9CQD8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Atp6v0e1Q9CQD8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Atp6v0e1Q9CQD8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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