Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms