Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc5Q9CQA1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms