Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700029P11RikQ9CQ68 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms