Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd2Q9CQ48 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms