Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp3Q9CQ10 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
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