Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg3Q9CPX6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg3Q9CPX6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms