Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Bcl11bQ99PV8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms