Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms