Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim26Q99PN3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trim26Q99PN3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms