Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Scd3Q99PL7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scd3Q99PL7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms