Protein–RNA interactions for Protein: Q99PH1

Lrrc4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc4Q99PH1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Lrrc4Q99PH1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Lrrc4Q99PH1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc4Q99PH1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc4Q99PH1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc4Q99PH1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc4Q99PH1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc4Q99PH1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc4Q99PH1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc4Q99PH1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc4Q99PH1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc4Q99PH1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc4Q99PH1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc4Q99PH1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc4Q99PH1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc4Q99PH1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc4Q99PH1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc4Q99PH1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc4Q99PH1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc4Q99PH1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc4Q99PH1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc4Q99PH1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc4Q99PH1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrc4Q99PH1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms