Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cep41Q99NF3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cep41Q99NF3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms