Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NsmfQ99NF2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NsmfQ99NF2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
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