Protein–RNA interactions for Protein: Q99NC0

Vgll1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll1Q99NC0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms