Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ubqln4Q99NB8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Ubqln4Q99NB8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Ubqln4Q99NB8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubqln4Q99NB8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubqln4Q99NB8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Ubqln4Q99NB8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubqln4Q99NB8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubqln4Q99NB8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Ubqln4Q99NB8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubqln4Q99NB8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubqln4Q99NB8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Ubqln4Q99NB8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Ubqln4Q99NB8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubqln4Q99NB8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubqln4Q99NB8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubqln4Q99NB8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubqln4Q99NB8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubqln4Q99NB8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubqln4Q99NB8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubqln4Q99NB8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubqln4Q99NB8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubqln4Q99NB8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubqln4Q99NB8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubqln4Q99NB8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubqln4Q99NB8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubqln4Q99NB8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubqln4Q99NB8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubqln4Q99NB8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubqln4Q99NB8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms