Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Ms4a4dQ99N05 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Ms4a4dQ99N05 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Ms4a4dQ99N05 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a4dQ99N05 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a4dQ99N05 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a4dQ99N05 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a4dQ99N05 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a4dQ99N05 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a4dQ99N05 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a4dQ99N05 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4dQ99N05 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4dQ99N05 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4dQ99N05 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4dQ99N05 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4dQ99N05 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4dQ99N05 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4dQ99N05 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4dQ99N05 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4dQ99N05 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4dQ99N05 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4dQ99N05 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4dQ99N05 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4dQ99N05 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4dQ99N05 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4dQ99N05 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4dQ99N05 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4dQ99N05 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4dQ99N05 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a4dQ99N05 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a4dQ99N05 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a4dQ99N05 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a4dQ99N05 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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