Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rnf17Q99MV7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rnf17Q99MV7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rnf17Q99MV7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rnf17Q99MV7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Rnf17Q99MV7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Rnf17Q99MV7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rnf17Q99MV7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rnf17Q99MV7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Rnf17Q99MV7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rnf17Q99MV7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rnf17Q99MV7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rnf17Q99MV7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rnf17Q99MV7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rnf17Q99MV7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rnf17Q99MV7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rnf17Q99MV7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rnf17Q99MV7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rnf17Q99MV7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rnf17Q99MV7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rnf17Q99MV7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rnf17Q99MV7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rnf17Q99MV7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rnf17Q99MV7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Rnf17Q99MV7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rnf17Q99MV7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rnf17Q99MV7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rnf17Q99MV7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rnf17Q99MV7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rnf17Q99MV7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rnf17Q99MV7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rnf17Q99MV7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rnf17Q99MV7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rnf17Q99MV7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rnf17Q99MV7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rnf17Q99MV7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rnf17Q99MV7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Rnf17Q99MV7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Rnf17Q99MV7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms