Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR8

Mccc1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc1Q99MR8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mccc1Q99MR8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mccc1Q99MR8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mccc1Q99MR8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mccc1Q99MR8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mccc1Q99MR8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mccc1Q99MR8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mccc1Q99MR8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mccc1Q99MR8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mccc1Q99MR8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mccc1Q99MR8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Mccc1Q99MR8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mccc1Q99MR8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mccc1Q99MR8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mccc1Q99MR8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mccc1Q99MR8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mccc1Q99MR8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms