Protein–RNA interactions for Protein: Q99M87

Dnaja3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja3Q99M87 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnaja3Q99M87 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnaja3Q99M87 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnaja3Q99M87 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnaja3Q99M87 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnaja3Q99M87 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnaja3Q99M87 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnaja3Q99M87 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnaja3Q99M87 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnaja3Q99M87 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnaja3Q99M87 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnaja3Q99M87 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnaja3Q99M87 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnaja3Q99M87 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnaja3Q99M87 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnaja3Q99M87 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaja3Q99M87 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaja3Q99M87 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaja3Q99M87 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaja3Q99M87 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaja3Q99M87 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaja3Q99M87 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaja3Q99M87 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaja3Q99M87 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaja3Q99M87 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaja3Q99M87 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaja3Q99M87 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaja3Q99M87 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaja3Q99M87 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaja3Q99M87 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaja3Q99M87 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaja3Q99M87 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaja3Q99M87 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaja3Q99M87 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnaja3Q99M87 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Dnaja3Q99M87 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Dnaja3Q99M87 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Dnaja3Q99M87 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnaja3Q99M87 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms