Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp16Q99LG0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp16Q99LG0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms