Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RtcbQ99LF4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms