Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nmd3Q99L48 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nmd3Q99L48 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms