Protein–RNA interactions for Protein: Q99KV1

Dnajb11, DnaJ homolog subfamily B member 11, mousemouse

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb11Q99KV1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnajb11Q99KV1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnajb11Q99KV1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Dnajb11Q99KV1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnajb11Q99KV1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Dnajb11Q99KV1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnajb11Q99KV1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Dnajb11Q99KV1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Dnajb11Q99KV1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Dnajb11Q99KV1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Dnajb11Q99KV1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Dnajb11Q99KV1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Dnajb11Q99KV1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Dnajb11Q99KV1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Dnajb11Q99KV1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajb11Q99KV1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajb11Q99KV1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajb11Q99KV1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnajb11Q99KV1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajb11Q99KV1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajb11Q99KV1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajb11Q99KV1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajb11Q99KV1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajb11Q99KV1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajb11Q99KV1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajb11Q99KV1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajb11Q99KV1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajb11Q99KV1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajb11Q99KV1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnajb11Q99KV1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Dnajb11Q99KV1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms