Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf19Q99KP6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf19Q99KP6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf19Q99KP6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf19Q99KP6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf19Q99KP6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf19Q99KP6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf19Q99KP6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf19Q99KP6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf19Q99KP6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf19Q99KP6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf19Q99KP6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf19Q99KP6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf19Q99KP6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf19Q99KP6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf19Q99KP6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf19Q99KP6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf19Q99KP6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf19Q99KP6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf19Q99KP6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prpf19Q99KP6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prpf19Q99KP6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prpf19Q99KP6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prpf19Q99KP6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prpf19Q99KP6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf19Q99KP6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms