Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ubxn2aQ99KJ0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn2aQ99KJ0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms