Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hps4Q99KG7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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