Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC8

Vwa5a, von Willebrand factor A domain-containing protein 5A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5aQ99KC8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vwa5aQ99KC8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vwa5aQ99KC8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vwa5aQ99KC8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Vwa5aQ99KC8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vwa5aQ99KC8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vwa5aQ99KC8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vwa5aQ99KC8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vwa5aQ99KC8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vwa5aQ99KC8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vwa5aQ99KC8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vwa5aQ99KC8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vwa5aQ99KC8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vwa5aQ99KC8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vwa5aQ99KC8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vwa5aQ99KC8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Vwa5aQ99KC8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vwa5aQ99KC8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vwa5aQ99KC8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vwa5aQ99KC8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vwa5aQ99KC8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vwa5aQ99KC8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vwa5aQ99KC8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vwa5aQ99KC8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vwa5aQ99KC8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vwa5aQ99KC8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vwa5aQ99KC8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vwa5aQ99KC8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vwa5aQ99KC8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vwa5aQ99KC8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vwa5aQ99KC8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vwa5aQ99KC8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms