Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GatbQ99JT1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GatbQ99JT1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GatbQ99JT1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms