Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms