Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddb2Q99J79 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms